回答を編集中に「解決済み」で閉じられてしまいました・・・
長文ですが、折角なので別掲で投稿させて頂きます。

by ドイリー
吹き出し素材のサムネ・背景色について質問です。
https://ask.clip-studio.com/ja-jp/detail?id=51886

参考になるか分かりませんが、
以前、サポートへ質問したことがありました。

＜要約＞長文なので、興味のない方はスルーしてください！
一応、１次要約としてサポート担当様とのやり取りを示しました。
更に、２次要約をしようとしましたが時間の関係と質問のニュアンスの消失への懸念で
断念しました。すみません・・・

結論▼
ある一定の原則はあるみたいです！
・素材登録時に素材パレットに登録される素材サムネイルの背景については、
　素材に使用されている色によって自動的に薄いグレーの背景か黒い背景の
　どちらで表示されるようになっております。
しかし、本質問◆に関しては完結していません！

経過▼
質問2020年05月10日～05月11日

下記は、質問以前のリリース報告です。
Version 1.9.5 の修正内容（2019年12月5日公開）
https://www.clipstudio.net/ja/dl/release_note_old/#195

その後、連絡なし

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＜要約＞
◆素材のフキダシの下地がpngの透過下地の様に黒になってしまいました？
質問▼
登録結果の素材パレットを見ると「黒い背景のフキダシ」がいくつかあります。
png画像の透過下地と同様に、黒は透過された下地部分の表現方法でした。
作業結果は下地部分が黒でなく、こちらが正解かと思いますが「薄いグレー」のものが大半です。
確認するとこの「薄いグレー」部分も透過状態でした。
この「黒い背景のフキダシ」の素材を正常な「薄いグレー」のフキダシに変更する方法はありますか？
回答▼
素材登録時に素材パレットに登録される素材サムネイルの背景については、
素材に使用されている色によって自動的に薄いグレーの背景か黒い背景の
どちらで表示されるようになっております。

ご申告の状況から、黒い背景で素材登録された吹き出し素材については、
黒い線が含まれていない白のみのフキダシ素材になっているかと思われますが、
この場合には、自動的に黒い背景となります。

恐れいりますが、現状背景の色を変更する機能についてはご用意がないため、
こちらの点についてはご要望として承らせていただきます。

質問▼
説明の意味が不明です？
なお、素材への再登録で解消する場合もあります！

回答▼
添付いただきました画像の「キャンバスに貼り付け」の下部に表示されております
フキダシを拝見したところ、どちらのフキダシも[線の色]が[黒]、[下地の色]が[白]に
なっているようでした。

この場合、黒が素材に含まれているため、素材サムネイルの背景が自動的に薄いグレーで
登録されるようになっています。

質問▼
説明に食い違いがあるように思えます？
[オブジェクト]サブツールでフキダシの線の色は[黒]です。
[下地の色]が[白]の状態とは何処の表示ですか？

また、このフキダシで最初（素材の図）の素材の登録時に下記を示しました。
・上のフキダシの背景が薄い[グレー]
・下のフキダシの背景が[黒]

次に、読み出したこのフキダシを再度素材登録（素材の再登録の図）して下記を示しました。
・上のフキダシの背景が薄い[グレー]
・下のフキダシの背景も薄い[グレー]

最初は下のフキダシで背景が[黒]で、再登録時は背景が薄い[グレー]（正解）になりましたが、
この説明の回答はいただいていません！
なお、素材への再登録でフキダシの背景が[黒]のままで正常にならないケースもあります！

回答▼
こちらの点について、現在のフキダシの状態を確認させていただきたく思いますので、
[ツールプロパティ]パレットを開かれた状態で、背景が[黒]のままになっている
フキダシ素材をキャンバスに貼り付けていただいた後、[オブジェクト]サブツールで
フキダシを選択し、モニター画面全体のスクリーンショットを撮影いただき、
こちらまで添付をお願いできますでしょうか。
質問▼
前回添付した画像３は、作成したclipファイル上でオブジェクトツールを操作していました。
フキダシのレイヤを正確に選択していなかった可能性があります！
今回、[オブジェクト]サブツールで表示されているので前回の操作にミスがあった様です。

回答▼
添付いただいた画像を拝見すると、フキダシの形状が
キャンバスに貼り付ける前の素材の状態と、素材の再登録をいただいた状態とで
異なっているようでした。

質問▼
ハッキリ覚えてはいませんが名称から推定すると下記だと思います。
①ComicStudio4.0でデフォルト素材のフキダシを読み出し
②ComicStudio4.0でユーザ用に分類して素材へ登録して作品に使用していた。（シッポあり）
③クリスタで素材のコンバート後、読み出して再分類していたものを
　今回不都合なシッポを削除するために再度素材登録をした。
基本的にComicStudio4.0とクリスタで読み出し＋分類＋再登録（シッポの操作）だと思います。

回答▼
再登録の際に、シッポの操作を行われたとのことですので、
その際に、フキダシに何らかの変更が加えられたものと思われます。

本件については、こちらでも調査を行い、想定される原因など確認でき次第、
ご報告させていただきます。